最近,科技领域爆出一则令人鼓舞的消息,谷歌公司成功拿下了一项创新专利,这一专利代表了生物技术和药物科学领域的巨大进步。据了解,该专利的焦点是一种先进的蛋白质设计系统,它基于全原子表征扩散模型,实现了史无前例的设计精准度和效率。
专利编号为WO2024240774A1,全名为《基于全原子表征的蛋白质设计扩散模型》。这套系统的问世,归功于DeepMind团队的杰出工作。他们巧妙地将尖端的神经网络技术与扩散方法相结合,实现了原子级别的蛋白质设计。
传统蛋白质设计过程复杂且效率不高,需要分别进行结构预测和序列优化。而谷歌的这项新专利彻底改变了这一现状,它将结构预测和序列优化整合在一次前向传递中,极大简化了设计流程,提高了效率。
该系统的核心在于全原子表征管理。为了精确控制蛋白质残基内的原子,研究者们创新性地运用了“抛弃式空间位置”策略,巧妙地处理原子级数据,有效规避了传统相位机制的复杂性。
该系统还实现了结构-序列预测的一体化。在一次前向传递中,它能同时整合结构和序列的预测,这不仅显著提高了计算效率,还简化了操作流程。
此外,系统还融入了基于目标分子结构信息的条件去噪过程。这一创新使得系统能根据特定功能和结合特性,定制设计蛋白质,为生物技术和药物研发领域开辟了新的可能性。
整个系统由扩散模型系统、原子控制框架和集成系统三部分构成。其工作原理精巧:首先,系统生成含噪声的分子数据,并结合目标分子信息,用临时位置初始化未使用的原子数据空间位置。接着,通过迭代优化逐步降低噪声,并动态调整原子位置,同时整合结构-序列预测,减少计算冗余。最终,生成高精度的优化蛋白质结构,验证序列准确性,并进行质量检验,确保设计的结构稳定可靠。
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