在癌症治疗的过程中,早期发现一直是一个难题。近年来,液体活检技术凭借其无创性和高灵敏度受到了广泛关注。不过,目前许多检测技术主要依赖深度靶向测序,难以整合多种数据类型,这影响了其灵敏度和特异性。
针对这一技术瓶颈,牛津大学的研究团队开发了一种创新的多模态循环肿瘤DNA(ctDNA)检测方法,该方法基于全基因组的TET辅助吡啶硼烷测序(TAPS)。这一技术的最大优势在于,它能够同时分析基因组和甲基化数据,使得癌症诊断的灵敏度达到了94.9%,特异性也达到了88.8%。这一突破性技术为癌症的早期筛查和患者分层提供了新的可能性。
该研究题为“Multimodal cell-free DNA whole-genome TAPS is sensitive and reveals specific cancer signals”,于2025年1月8日发表在《Nature Communications》期刊上。研究背景显示,尽管癌症早期检测对改善患者预后至关重要,但目前的筛查方法仅能覆盖不到30%的癌症类型,且许多方法需要侵入性检查,接受度较低。多癌种早期检测技术虽然可以实现无创检测,但在无症状人群中往往假阳性率较高,这限制了其应用。
牛津团队的TAPS技术通过一种非破坏性方法,在低ctDNA含量下仍能保持高灵敏度。研究人员通过对61例癌症患者及30例非癌症对照的样本进行深度测序,验证了这一方法在多种癌症类型中的准确性。
团队还开发了一套多模态数据分析流程,将拷贝数变异、体细胞突变和甲基化信号进行整合,以提高ctDNA检测的灵敏度。结果显示,在临床样本中,这一方法的检测灵敏度达到85.2%,远高于单一数据模态的结果。
尽管这一方法在癌症早期检测和术后监测中展现出显著优势,但在实际应用中仍面临挑战,例如测序成本高昂和临床资源有限。未来的研究可以进一步优化测序技术,以扩大其在更多癌症类型中的适用性。
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