近日,麻省理工学院的科学家们推出了一款名为Boltz-1的强大开源人工智能模型,这一突破有望大幅提升生物医学研究和药物开发的效率。

Boltz-1成为首个在生物分子结构预测领域达到与谷歌DeepMind的AlphaFold3同等先进水平的完全开源模型。该模型的开发团队来自MIT Jameel机器学习健康诊所,主要领导人为研究生杰里米·沃尔文德和加布里埃尔·科尔索,合作团队还包括MIT研究员萨罗·帕萨罗、电气工程与计算机科学教授瑞吉娜·巴兹利和汤米·亚卡拉。

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在12月5日的发布会上,沃尔文德和科尔索强调,他们的目标是推动全球科学合作,加快科学发现进程,并为生物分子建模提供一个可靠的平台。科尔索表示:“我们希望这能成为社区发展的起点”,并指出命名“Boltz-1”而非“Boltz”的用意在于鼓励更多社区成员的参与。

蛋白质在几乎所有生物过程中扮演着关键角色,其形状与功能紧密相关。因此,了解蛋白质结构对于设计新药和创建具有特定功能的新蛋白质至关重要。由于蛋白质的氨基酸长链折叠成三维结构的过程极为复杂,准确预测其结构一直是科学界面临的难题。

DeepMind的AlphaFold2利用机器学习快速预测3D蛋白质结构,精确度之高令实验科学家难以区分。AlphaFold3在此基础上进一步优化,采用了生成式AI模型,但因非完全开源而受到科学界的批评。MIT研究团队因此开发了Boltz-1,遵循AlphaFold3的基本原理,并在其基础上进行改进,提高了模型的准确性和预测效率。

研究团队历时四个月,进行了多次实验,克服了蛋白质数据银行中的模糊性和异质性问题。最终实验结果显示,Boltz-1在复杂生物分子结构预测方面与AlphaFold3精度相当。

研究人员计划继续优化Boltz-1的性能,缩短预测时间。他们还邀请广大研究者在GitHub上试用Boltz-1,并通过Slack频道与其他用户交流,希望Boltz-1能促进更广泛的合作,激发社区的创造性应用。

项目地址:https://jclinic.mit.edu/democratizing-science-boltz-1/

重点提示:

🌍 Boltz-1是全球首个完全开源的生物分子结构预测模型,性能与AlphaFold3持平。

🧬 该模型的开发旨在促进全球合作,推动生物医学研究与药物开发。

🔬 MIT团队希望通过Boltz-1简化蛋白质结构预测,让更多科研人员能够利用这一强大工具。